Bonjour,
Oui, octobre c'est bien. En novembre, la saison des pluies peut commencer dans les Andes et en Amazonie. Généralement, elle attaque plutôt en décembre et s'intensifie en janvier/février. Par contre, pour la côté, novembre est mieux car c'est l'été qui approche à grands pas.
En ce qui concerne ton itinéraire:
Tu as évidemment les incontournables que tu iras voir automatiquement bien qu'ils soient au cœur du circuit touristique (ce qui est normal): Arequipa, Cusco, Titicaca et, peut être, Paracas, Ica (Huacachina) et Nasca.
Mais bon...
Le nord vaut aussi le détour avec, sans conteste, Chachapoyas et sa région. Pour y accéder, plusieurs options:
Soit bus direct depuis Lima (=23h), soit avion pour Trujillo ou Chiclayo. Tarifs supers avantageux avec Taca (
http://www.taca.com) si vous vous y prenez à temps.
De Trujillo ou Chiclayo, bus de nuit journalier et direct pour Chachapoyas avec Movil tour (bus camas, super conforts). Comptez 9h depuis Chiclayo et 11-12h depuis Trujillo.
L'avantage de passer par Trujillo-Chiclayo est de pouvoir se rendre aux Huacas et au musée de Tumbas Reales, certainement le plus beau du Pérou. Comptez 2-3 jours pour Trujillo-Chiclayo et 3 jours pour Chachapoyas puis, garder 2 semaines pour le sud. Vous aurez ainsi un aperçu un peu plus complet et réaliste que si vous vous limitez uniquement au sud.
Comme vous avez peu de temps, zappez peut-être Lima qui est, malgré son premier aspect un peu repoussant, une chouette ville si l'on a le temps de la découvrir.
A+