Bonjour Nathalie,
Octobre 2018 ? Vous vous y prenez à l'avance

La boucle de
Quilotoa est magnifique, c'est une super randonnée de 3/4 jours que vous pouvez faire toute seule. À cette période, vous devriez avoir beau temps et pouvoir profiter pleinement des paysages locaux. Il y a un peu de dénivelé mais ça se fait très bien en prenant son temps dans les montées.
Pour
Vilcabamba et sa région, c'est top aussi. Le
parc national Podocarpus est l'un de mes préférés en
Équateur. Il y a très peu de voyageurs dans le coin (et encore moins à cette période !), ça permet d'être vraiment en communion avec la nature. Vous avez plein de superbes randonnées à la journée ou des treks de plusieurs jours. Dans la forêt, il est toujours préférable d'être accompagné d'un guide local. Les lodges pourront vous aider.
La ville a aussi son charme, on s'y sent très vite comme chez soi. Ce n'est pas pour rien que c'est la "vallée des centenaires".
Entre les deux, vous avez les volcans
Sangay ou encore
Chimborazo, le fromage de
Salinas de Guaranda, le parc national Cajas, la ville coloniale de
Cuenca, les cascades et thermes de
Baños, le train
Nariz del Diablo, le marché de Guamote, les lagunes de Atillo, etc. Sur l'
avenue des volcans, vous avez des milliers de trésors

Bien sûr, si vous êtes dans le sud, privilégiez un départ de
Guayaquil pour les
Galapagos, c'est plus pratique. D'ailleurs, si vous pouvez prendre des billets multi-destinations incluant déjà ces vols, ça sera encore plus économique à priori.
Amicalement,
Léon