Akrotiri (carte) Au sud de l'île, Akrotiri est une ancienne cité minoënne vieille de 3 500 ans dont les fouilles ont mis à jour divers vestiges et témoignages présents sur le site ou au musée préhistorique de Fira. Le village actuel est aussi agréable avec ses ruelles, ses églises et ses plages avoisinantes.
Fira (carte) Appelée aussi Thira, c'est la ville principale de l'île et la plus touristique. A flan de falaise, elle est connue pour son architecture typique, ses ruelles, sa vue (et son coucher de soleil) sur la mer Égée, son vieux port auquel on descend par 588 marches ou en téléphérique, ainsi que son animation. Fira propose aussi plusieurs musées dont celui de la préhistoire.
Monastère du Profitis Ilias (carte) Il est situé sur le sommet de l'île (567 m), avec un joli panorama sur les environs. Ses sentiers d'accès sont appréciée des randonneurs, même si on peut aussi y accéder en voiture.
Oïa (carte) Comme Fira (en moins touristique), ce superbe village à flan de falaise est connu pour ses magnifiques couchers de soleil et son architecture typique. Là aussi on accède à ses deux ports par de longs escaliers.
Pyrgos Kallistis (carte) Il s'agit d'un joli petit village perché sur les contreforts du mont Profitis Ilias et entouré de vignobles. Il est constitué de ruelles qui courent le long d'habitations traditionnelles blanches. D'en haut, on bénéficie d'un beau panorama sur les environs.
Néa Kaméni (carte) Cette île inhabitée possède un volcan encore en activité qui culmine à 150 mètres, ce qui lui donne un air lunaire avec blocs de laves et fumerolles. On n'y accède qu'en tour organisé (pas mal de monde en été) même si ensuite on peut visiter l'île sans guide.
Paléa Kaméni (carte) Cet îlot volcanique inhabité (hormis la présence d'une petite église) à côté de Néa Kaméni est connu pour ses sources d'eaux chaudes aux couleurs orangées. C'est une étape-baignade pour les tours en mer organisés depuis Santorin.
Thirassia (carte) Quelques villages et hameaux répartis sur 10 km² de nature aride et sauvage et un contraste certain avec Santorin tant l'île est tranquille et peu touristique (y compris dans ses infrastructures). Pourtant on peut y faire de belles balades, profiter de ses plages de galets, y voir d'anciennes mines ainsi qu'une vingtaine de petites églises ou monastères.
Amorgos (carte) Des monastères, une nature préservée avec des sentiers de randonnée dans la montagne et quelques plages pour cette île qui a servi au tournage du film Le Grand Bleu.
Anafi (carte) C'est une petite île tranquille à côté de Santorin. On y trouve un monastère, des plages et des possibilités de treks.
Folégandros (carte) C'est un lieu tranquille à côté de Santorin avec de beaux paysages, des plages, des villages sympas et des possibilités de randonnées.
Ios (carte) L'île est spécialement faite pour les amateurs de fêtes et de vie nocturne sur fond de plages.
