Bonjour Louna,
A la lecture de ton message, en réservant un séjour/voyage via une agence en ligne, ce qu'on va te donner d'un côté (prix attractifs), te sera repris de l'autre (frais de réservations et autres) et tu auras les conseils et le service minimum : donc, en cas de problème, difficile de joindre un interlocuteur.
En passant par une agence de voyage, tu auras les conseils et en cas de pépin, tu sais vers qui te retourner.
Quoiqu'il en soit, bien lire les conditions de vente et d'annulation (c'est la partie barbante du formulaire de réservation, celle qu'on ne prend jamais le temps de lire car c'est écrit en tout petit).
Si non, tu peux construire ton séjour toi-même en consultant les sites de réservations d'hôtels (pour avoir le noms et la situation des établissements et à partir de là en cherchant le site internet tu peux réserver direct) et des compagnies aériennes (pour avoir les tarifs, les horaires...).
Enfin, n'oublie pas de prendre une bonne assurance voyage, te couvrant au maximum si tu envisages de partir dans des pays lointains.
Voilà pour ma petite contribution. N'hésite pas à demander si tu veux plus d'infos.