Je confirme que, pour les possesseurs d'une carte abonné air france, les vols AF**** et A5****, pris dans le cadre de l'abonnement ou non, sont qualifiants en dehors des exceptions citées plus haut. En ce qui me concerne, pour la réservation, je passe toujours soit par le site Air France, soit par Agence de Voyages, et tous mes vols depuis le 1er janvier 2013 ont été qualifiants.
Et pour répondre à la question initiale du sujet, j'avais également contacté Hop! au moment de sa création pour savoir si un vol Hop! à prix Basic acheté avec l'option cumul de miles à 5 € permettait d'obtenir également un vol qualifiant, il m'a été répondu que non: seuls les miles étaient crédités sur le compte flying blue, mais pas de vol qualifiant. Pour les prix Basic plus et Maxi Flex, avec la carte d'abonnement Air France, le vol est qualifiant et des miles sont crédités.