Bonjour,
Nous aussi nous partons en Septembre en
Malaisie, mais 15 jours c'est court pour faire tout le pays, nous nous partons 1 mois pour vraiment tout voir.
En sac à dos bien sur, c'est le meilleur moyen de partir à la découverte d'un pays

Après je peux vous dire que le guide du routard et le LP sont très bien pour organiser votre séjour et vous y trouverez la plupart des réponses à vos questions.
Pour ce qui est des transports vous aurez le choix entre le train et le bus dans la plupart des cas, sauf sur vous allez dans des coins reculer ou il faudra prendre soit la moto ou une pirogue.

Après pour les tarifs tout dépend des distance et du confort du transport (il y à 3 classes pour les train par exemple).
Dans certaines villes il ni a que 3 ou 4 bus par jour, donc faire attention aux horaires et bien arriver en avance sur place.
Les villes et lieux que vous avez choisi sont très bien, en plus en septembre c'est la période creuse dans les plupart des pays d'Asie.
Un petit conseil : faite si vous avez le temps
MOSSY FOREST (Cameron Highland), TAMAN NEGARA c'est superbe ! IPOH et KUALA TERENGANU.
Bonne journée à vous