Si la Crète ne compte pas de liaisons ferries internationales, elles bénéficie par contre de pas mal de lignes régulières directes à destination de la Grèce continentale et de plusieurs autres îles. Toutes partent de la côte nord, des ports (d'ouest en est) de Kissamos, La Canée, Rethymnon, Héraklion et Sitia. Anek Lines , Blue Star Ferries, Hellenic Seaways, Minoan Lines et SeaJets sont les compagnies opérant ses lignes dont certaines sont d'ailleurs "circulaires" avec plusieurs ports au programme. de/vers Héraklion:| • | Athènes/Le Pirée (Anek + Blue Star + Minoan) |
| • | Ligne circulaire Le Pirée - Milos - Santorin - Anafi - Héraklion - Sitia - Kasos - Karpathos - Rhodes (Anek). |
| • | Ligne circulaire Héraklion - Santorin - Ios - Naxos - Mykonos (SeaJets). |
| • | Ligne circulaire Héraklion - Santorin - Ios - Paros - Mykonos (Hellenic Seaways). |
de/vers Kissamos:| • | Ligne circulaire Kissamos - Anticythère - Cythère - Le Pirée (Anek). |
de/vers La Canée:| • | Athènes/Le Pirée (Anek + Blue Star). |
de/vers Rethymnon:de/vers Sitia:| • | Ligne circulaire Le Pirée - Milos - Santorin - Anafi - Héraklion - Sitia - Kasos - Karpathos - Rhodes (Anek). |
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