La situation sanitaire de l'Indonésie n'est pas mauvaise, mais demeure cependant assez variable selon les régions qui composent ce vaste pays, à plus forte raison d'ailleurs si on sort des sentiers battus ou que l'on s'aventure par exemple en Papouasie ou à Bornéo.Sur l'ensemble, ce sont d'abord toutes ces maladies portées par les moustiques qui posent généralement le plus de problèmes. Qu'il s'agisse de la dengue, du chikungunya, du zika, de l'encéphalite japonaise en milieu rural, mais aussi du paludisme qui est présent en différents endroits du pays (mais pas à Bali ni à Java), notamment en saison des pluies. Bref, comme toutes ces maladies proviennent donc de piqûres de moustiques, il sera indispensable de se protéger en prévoyant répulsifs et tenue adéquate, particulièrement en soirée, plus de dormir sous moustiquaire (imprégnée) ou dans des lieux climatisés.Sinon, même si officiellement rien n'est obligatoire pour entrer dans le pays en matière de vaccins, être à jour à ce niveau est préférable. Cela dit, pour ceux qui restent assez longtemps en zones rurales, surtout hors sentiers battus, un vaccin contre la rage qui est ici endémique, voire l'encéphalite japonaise, sont parfois recommandés par certaines instances.Comme dans beaucoup d'endroits, une bonne hygiène corporelle et davantage alimentaire sera nécessaire. Donc, évitez l'eau du robinet qui n'est pas potable, les glaçons et les plats ou aliments ne présentant pas toutes les garanties de fraîcheur, spécialement sur les marchés. Et cela pour au moins éviter déjà la turista, cette diarrhée bien connue qui, à l'occasion, guette le voyageur.Peut‑être plus qu'ailleurs en Asie du Sud‑est, on note réellement en Indonésie une santé à deux vitesses. Avec Jakarta, quelques grandes villes et surtout les zones touristiques qui bénéficient d'un très bon niveau, via en premier lieu des structures privées (très) chères, et de l'autre le reste du pays largement moins pourvu sinon dépourvu. Au point que parfois, pour les choses les plus graves, il faut alors envisager des évacuations vers Jakarta ou Bali. Ce qui fait qu'une bonne assurance‑assistance est ici largement recommandée.

Le niveau de sécurité en la matière est plutôt satisfaisant en Indonésie. On assiste cependant depuis quelques années à une recrudescence de la petite délinquance dans les lieux touristiques, à commencer par Bali, avec une forte augmentation du nombre de délits. Ceci étant, avec un minimum d'attention et de bon sens, les risques demeurent faibles.Vu la taille de l'archipel, son histoire et les spécificités locales, l'Indonésie connaît régulièrement des tensions et conflits violents allant du terrorisme islamiste aux problèmes inter‑ethniques comme en Papouasie où cela est assez récurrent. Donc, sans être "parano", il est conseillé d'être vigilant, spécialement en périodes de manifestations, et de se tenir informé sur la situation du moment selon les endroits où on souhaite se rendre, à plus forte raison si on voyage loin des principales zones touristiques.Au‑delà des risques de tsunami bien présents dans toute la région, de même que les possibilités d'inondations en saison des pluies, notamment à Java, une bonne partie de l'Indonésie est une zone sismique avec plusieurs volcans en activité. Dans un autre domaine, on ne doit pas oublier les précautions de base lors de treks ou si on voyage dans des zones reculées.

En cas de problèmes lors d'un voyage à l'étranger, les services consulaires de votre pays peuvent vous aider. À savoir aussi que, si vous êtes ressortissant de l'Union Européenne et que votre pays n'est pas représenté, vous pouvez alors vous adresser à n'importe quelle autre représentation d'un état membre de l'Union européenne.

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