L'Afrique de l'Est est une région qui peut s'avérer problématique pour le voyageur selon les époques et les endroits. Nombre de maladies en tous genres sont en effet déjà bien présentes. À cela s'ajoute pour pas mal de pays un climat insécuritaire, aussi bien lié à la criminalité qu'aux problèmes socio‑politiques, qui fait d'ailleurs que nombre de régions sont fortement déconseillées, voire interdites aux visiteurs (la Somalie étant de loin le pire). Bref, plus que partout ailleurs une certaine prudence s'impose à tous niveaux et il sera toujours nécessaire de se renseigner avant sur la situation du moment lorsqu'on voyage en individuel selon les endroits où on souhaite aller.

Comme toujours, et‑ à plus forte raison si on sort des sentiers battus, une bonne hygiène corporelle et alimentaire est nécessaire si on est pas habitué à "manger local". Dans ce cas, évitez les plats ou aliments ne présentant pas toutes les garanties de fraîcheur, ne serait‑ce déjà que pour éviter la turista. Quant à l'eau du robinet, mieux vaut lui préférer l'eau minérale.

C'est un gros fléau dans nombre de pays à commencer par le Kenya. Donc des risques "classiques" aussi bien de vols à la tire, agressions, escroqueries en tous genres, etc, que de choses plus "locales" comme les attaques de véhicules par des coupeurs de route. En conséquence mieux vaut prendre ses précautions et toujours rester vigilant en toutes occasions. Dans un autre domaine, à noter que les abords des côtes somaliennes sont de fortes zones de piraterie maritime.