Comme toujours, mieux vaut être à jour de ses vaccins même si officiellement rien n'est obligatoire pour entrer dans le pays.Le Salvador ne pose pas trop de problèmes sanitaires même si la dengue ou le chikungunya, véhiculés par certains moustiques, y sont présents comme dans nombre d'endroits de cette partie du monde. Quant au paludisme, il n'est là que très localement (en dessous de 1 500 m) ou ponctuellement en saison de pluies au point que bien peu de voyageurs utilisent un traitement, lui préférant la prévention. Pour se protéger justement, le mieux demeure d'avoir un bon répulsif, se couvrir les bras et les jambes à la tombée de la nuit lorsque ça pique le plus, et de prévoir une moustiquaire imprégnée si on dort dans un lieu sans climatisation ou air brassé.Une bonne hygiène corporelle et surtout alimentaire est nécessaire si on souhaite "manger local". Donc évitez l'eau du robinet qui n'est pas vraiment potable et les plats ou aliments ne présentant pas toutes les garanties de fraîcheur, ne serait‑ce déjà que pour éviter la turista.

C'est le plus gros problème du pays depuis des années. Le Salvador présente en effet un taux d'homicides et de violences très élevé, notamment en milieu urbain et périurbain. Même si cette insécurité concerne en tout premier lieu la population locale et est le fait de gangs en conflits quasi permanents (les fameux "maras"), mieux vaut prendre toutes ses précautions et faire attention même en tant que touriste, surtout si on voyage en individuel. À noter aussi des risques de braquages dans les transports en commun qui là concernent tout le monde.Dans tous les cas, il est impératif de bien se renseigner sur la situation du moment lorsqu'on sort des endroits touristiques; certaines régions du pays étant en effet plutôt déconseillées. Reste que les autorités font leur possible pour sécuriser les zones touristiques ou encadrer les trekkeurs via notamment la présence d'une police touristique appelée Politur.La nature au Salvador peut s'avérer capricieuse. Comme la plupart des contrées de la région, le pays est situé sur une zone sismique, sur le passage des tempêtes ou des cyclones, et ses volcans entrent parfois en éruption. Fort heureusement, ces aléas ne sont pas si fréquents et c'est surtout à des routes secondaires coupées qu'on pourra avoir à faire face en saison des pluies.

En cas de problèmes lors d'un voyage à l'étranger, les services consulaires de votre pays peuvent vous aider. À savoir aussi que, si vous êtes ressortissant de l'Union Européenne et que votre pays n'est pas représenté, vous pouvez alors vous adresser à n'importe quelle autre représentation d'un état membre de l'Union européenne.Consulat Général: 1a Calle Poniente, 3718 Colonia Escalon, San Salvador. Tél.: +503 25 21 90 00. À noter que l'ambassade de France et ses services au Salvador sont également en charge du Belize.Belgique: Consulat honoraire: Ave. Las Magnolias 172, Colonia San Benito, San Salvador. Tél.: (+503) 2 263 84 64.Canada: Consulat Général: Centro Financiero Gigante, 63 Avenida Sur y Alameda Roosevelt, Local 6, Nivel II, San Salvador. Tél.: (+503) 2279‑4655.Suisse: Consulat général: Sucursal Galerias Escalón, Apartado Postal 72, San Salvador. Tél.: (+503) 2264 1177.