Urizen, en cette période, il y aura beaucoup de monde dans la région du
Fuji-san.
Je pense que l'option
Kyoto est effectivement la plus intéressante en alternative à
Tokyo. Mais ne réduit pas pour autant ton séjour à
Tokyo : c'est bien de se donner le temps d'y rester un moment et de découvrir cette ville fantastique (tu peux d'emblée t'éviter le sempiternel périple vers
Kamakura... surtout que, question temples, tu auras ce qu'il faut à
Kyoto...).
Juste pour te prévenir : tu pars pendant la pire période météo (j'imagine que tu n'as pas trop le choix...) : très très chaud, et terriblement humide (c'est même carrément la période des pluies...).
Pour y échapper un peu, tu peux, à la place de
Kyoto, t'évader à
Hokkaido, température clémente en cette période (environ 25 degrés) et air plus sec... Mais il faut prendre l'avion puis, idéalement, louer une voiture. C'est un autre budget... quoique, cela t'évite d'acheter le JR Pass...