Bonjour,
Quelques commentaires en addition à ce qui vous a déjà été suggéré.
J1) Asakusa, Ueno, Tokyo Sky Tree, Ryogoku, -- soir Akihabara
Asakusa et Ueno sont deux zones relativement étendues, la Skytree et le centre Solamachi à son pied aussi, quant à Ryogoku, ce n'est pas juste à côté.
A Asakusa, on peut louer des vélos pour 200 yens la journée (juste en dessous de l'embarcadère pour les bateaux allant à Odaiba, les "Suijo-bus", à gauche du pont traversant la Sumida), ce qui permet d'explorer les petites rues de ces quartiers, qui recèlent les plus intéressantes attractions (artisans, commerces, petits musées, ...).
A Ryogoku, outre le Kokugikan, les Heyas (confréries où s'entraînent les sumotoris), les commerces et les restaurants de chanko-nabe (la nourriture de base des sumo), il faut visiter le musée Edo-Tokyo, qui couvre l'histoire de la ville.
J'allais oublier: pour la Skytree, on peut réserver des billets au centre de voyage Tobu à Asakusa:
http://www.tobu.co.jp/foreign/contact.html. Malheureusement, la réservation par internet n'est possible qu'avec une carte de crédit japonaise ... 😕
J2) Shinjuku (observatoire et parc), après-midi Odaiba (shopping)-- soir Odaiba
Deux zones trop loin l'une de l'autre. Couplez Shinjuku avec Shibuya, Harajuku etc.
Odaiba est plus logiquement couplé avec Tsukiji, Ginza, la Tokyo Tower ou même Asakusa. Allez-y par bateau au départ soit de Asakusa, soit de Hinode-Pier (près de Hamamatsu), soit du parc Hama-Rikyu (qui mérite davantage la visite que les jardins du palais impérial), à côté de Tsukiji. La traversée offre une vue différente et fascinante de la ville depuis la baie. Revenez par le métro qui passe sur le pont.
Je verrais selon les avis si ajouter 1j de plus a tokyo ou pas.
Vu la taille de la ville, c'est toujours une bonne idée, si on aime les villes évidemment.