Bonjour,
par mesure de précaution, je stocke mes originaux sur un disque dur séparé. Quand je veux retravailler des photos, je les copie sur le DD de mon ordinateur dans un dossier de travail, ce qui évite le risque de bousiller les originaux. C'est une précaution toute bête, d'autant plus facile à prendre que les disques durs sont désormais extrêmement bon marché.
Je ne connais pas ACDSee, mais je suppose que si tu pars d'un fichier RAW ou JPG tu te retrouves avec un fichier RAW ou JPG à la sortie, non ? Sinon, au moment d'enregistrer ton image recadrée, il te suffit de choisir Enregistrer sous dans le menu Fichier (cette option existe dans tous les logiciels) et de sélectionner alors le format de ton choix.