Il existe une quinzaine de parcs nationaux et autant de réserves naturelle dans le pays. Parmi les sites naturels les plus "intéressants" au niveau touristique, on notera:
Parc national de l'Ichkeul: situé pas loin de Bizerte, l'endroit est inscrit à l'Unesco. Il se compose de marais, d'un lac et de petites montagnes qui abritent nombre d'espèces d'oiseaux.
Au sud
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Chott el-Jerid: c'est le plus célèbre chott (étendue d'eau salée dans le désert) de Tunisie. On y vient pour ses paysages et les oasis qui l'entourent (Nefta, Tozeur...).
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Gorges de Selja: une belle vallée encaissée au nord du Chott el‑Jerid qu'on peut découvrir avec le Lézard Rouge qui est un train touristique qui circule au départ de Metlaoui.
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Grand erg oriental: c'est la partie saharienne de la Tunisie avec ses dunes et ses oasis. C'est devenu un haut lieu du tourisme tunisien.
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Parc national de Jbil: le plus grand parc tunisien au sud‑est du Chott el‑Jerid. Il présente un mélange de grandes dunes et de formations rocheuses parmi lesquels vivent des gazelles, des fennecs et nombre d'espèces d'oiseaux.
