Au niveau hébergements, l'archipel dispose de logements chez l'habitant (y compris si l'on souhaite juste poser sa tente) et de petits hôtels sur les îles d'Isabela, San Cristobal, Floreana et Santa Cruz (notamment à Puerto Ayora). De toutes, c'est cette dernière qui dispose du plus de capacités. Comptez en gros 20 US$ la double pour ce qui est des premiers prix. En saison (juillet‑août ou Noël), il peut être utile de réserver. À savoir aussi que nombre de croisières incluent dans leurs tarifs des nuits à bord des bateaux, ce qui peut être une bonne solution en matière d'hébergement et d'économies.