parfois aussi les agences n'envoient leurs références clients que quelques jours avant le départ du vol; vos places sont alors bel et bien réservées sur le vol en question mais vous ne pourrez pas choisir vos sièges même si le web check-in existe sur cette compagnie, ils vous seront attribués d'office.
j'ai eu ce souci en ayant réservé un séjour via une agence (allemande), avec un vol Air Berlin; j'ai tout simplement envoyé un mail à AB en expliquant que j'aurais aimé enregistrer sur le net et ils m'ont aimablement fourni le n° à 6 chiffres/lettres afin que je puisse le faire

idem au retour, alors qu'à l'aéroport quelques jours avant le gars pas très aimable m'avait juste répondu que mon tarif ne m'autorisait pas à le faire!

à tenter donc mais je ne sais pas si toutes les compagnies ont le même sens du service!