Domoni (carte) Seconde ville de l'île avec une partie ancienne dans sa médina, quelques vestiges de remparts, et le mausolée du premier président des Comores Ahmed Abdallah.
Parc du mont Ntringui (carte) Ce vaste parc englobe le Mont Ntringui, point culminant d'Anjouan (1 595 m), plus le Lac Dzialandzé connu au niveau ornithologique.
Iconi (carte) On peut voir un ancien palais royal et de belles falaises dans cette ancienne capitale de sultanat située à quelques kilomètres au sud de Moroni.
Mitsamiouli (carte) Plusieurs belles plages de sable blanc (et un petit lac) autour de cette localité de l'extrême nord en font l'endroit le plus "touristique" de l'île.
Moroni (carte) Capitale et plus grande agglomération des Comores, Moroni concentre la plupart des services et de l'animation de l'archipel. La ville possède une médina, nombre de mosquées avec l'Ancienne Mosquée de Vendredi qui demeure la plus connue, ainsi que des plages et le volcan Karthala dans ses environs.
Volcan Karthala (carte) Cet impressionnant volcan actif dominant la ville de Moroni peut se gravir en randonnée. C'est le point culminant de l'archipel avec ses 2 361 m.
Hoani (carte) C'est un village de la côte nord avec de jolies plages (comme presque partout sur l'île) et un site de reproduction pour les tortues marines.
Nioumachoua (carte) Il s'agit de la localité à laquelle est rattaché le parc marin de Mohéli. Un petit secteur d'écotourisme s'est développé autour de celui-ci avec ses belles plages (notamment sur les îlots qui lui font face), les possibilités de plongées, de balades à pied ou en bateau, et de découvertes des bourgades avoisinantes.
Parc marin de Mohéli (carte) Cette belle zone le long de la côte sud de Mohéli abrite une grande diversité au niveau faune et flore marines. C'est aussi un lieu de ponte pour les tortues vertes. On peut y faire de la plongée.