Sur les 34 sites du pays inscrits au patrimoine mondial de l'Unesco, la Basse‑Californie en compte trois:

Îles du golfe de Californie (2005) (carte) 244 îles (plus les côtes) appréciées pour leurs fonds et leur faune marine (baleines, dauphins…) en plus de leurs paysages.

Sanctuaire des baleines d'El Vizcaino (1993) (carte) Classé à l'Unesco, ce site à la fois marin et terrestre est le lieu d'hivernage des baleines grises ainsi que d'autres espèces (lions de mer, tortues…).

Sierra de San Francisco (1993) (carte) Il s'agit d'un ensemble de grottes de la Sierra de San Francisco, patrimoine de l'Unesco, qui abritent des peintures rupestres considérées parmi les plus belles au monde.