Les Galapagos sont au niveau touristique une destination assez particulière dans le sens où ce qui est possible ou pas de faire est très réglementé. C'est aussi un lieu dont la découverte passe en très grande partie par des formules de croisières organisées sans possibilité d'y échapper. Sur l'ensemble de l'archipel, c'est logiquement sur les îles habitées qu'on disposera du plus de "liberté" dont en premier lieu sur Santa Cruz où il est possible de visiter la Station de Recherches Charles Darwin, voir les animaux à la baie des Tortues, ou randonner vers l'intérieur de l'île. Sinon, il y a en gros 120 sites de l'archipel ouverts aux visites encadrées, moitié terrestre et moitié marin (notamment pour la plongée), et une multitude d'autres non accessibles au public. | Baltra (carte)
C'est là qu'est situé le principal aéroport des Galapagos. |
 | Bartolome (carte)
C'est une petite île pas mal visitée où on peut voir entre autres des pingouins et des tortues dans un beau cadre minéral et désolé. On peut aussi s'y baigner et faire de la plongée. |
 | Espanola (carte)
Un endroit assez reculé de l'archipel avec en contrepartie une faune très riche, notamment au niveau ornithologique. On y fait de la plongée. |
 | Fernandina (carte)
La plus à l'ouest des îles de l'archipel. Des iguanes parmi les champs de laves et des colonies de pingouins, lions de mer et phoques. |
| Floreana (carte)
Habitée par juste une centaine de personnes, l'île (appelée aussi Santa Maria) offre quelques possibilités de plongée et d'observation de la faune sur une de ses plages. |
| Genovesa (carte)
Cette terre en partie boisée au nord-est de l'archipel abrite beaucoup d'espèces d'oiseaux. |
 | Isabela (carte)
C'est la plus grande île avec Puerto Villamil comme bourg principal. Elle abrite une demi-douzaine de volcans. On peut faire plusieurs excursions sur Isabela sans avoir à passer par un tour organisé en bateau. |
| San Cristobal (carte)
C'est l'île la plus à l'est avec Puerto Baquerizo Moreno qui est la "capitale" des Galapagos. On peut visiter une partie de l'île seul et y pratiquer la plongée. |
| San Salvador (carte)
On trouve sur cette terre - appelée aussi Santiago - une large variété d'animaux (oiseaux, phoques, tortues, etc). |
 | Santa Cruz (carte)
C'est l'île la plus peuplée avec Puerto Aroya comme centre touristique et d'organisation des visites. On y pratique la plongée et on y fait quelques randonnées à la découverte de la faune et des paysages volcaniques. |
 | Santa Fé (carte)
Des forêts de cactus, des falaises, des oiseaux, des iguanes et des lions de mer pour cette petite île entre Santa Cruz et San Cristobal. |
| Wolf (carte)
Petite île montagneuse où vivent nombre d'oiseaux, iguanes, phoques, requins et baleines. |
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: défavorable.