Même si Mayotte ne pose pas de gros problèmes sanitaires, il vaut mieux prendre quelques précautions de base pour s'éviter la dengue, le chikungunya ou le paludisme qui ponctuellement et/ou localement sont présents. En premier lieu, il convient donc de se protéger des moustiques, et des autres insectes par la même occasion, en prévoyant répulsifs et moustiquaire, surtout en saison des pluies. Pour le palu, certains préconisent un traitement pour les séjours un peu longs même si très très peu de gens sur place suivent cette recommandation.Peu de risques et l'eau est potable partout. Par contre, pensez à bien vous hydrater et protéger du soleil aux périodes les plus chaudes.Mayotte possède un bon système sanitaire avec cinq hôpitaux et plusieurs dispensaires. En cas de problèmes graves, des évacuations vers la Réunion peuvent aussi être envisagées. Quant au fonctionnement, remboursement des soins, etc, tout fonctionne comme en métropole.

Si pendant longtemps Mayotte ne présentait qu'assez peu de problèmes en matière de criminalité et délinquance, la situation s'est malheureusement bien dégradée ces dernières années. L'île connait ainsi une large délinquance. Les cambriolages dans les maisons (d'où le gardiennage en cas d'absence), les vols dans les voitures et accessoirement les braquages sur les plages peu fréquentées sont désormais très courants.Après une longue période de manifestations - parfois violentes - en 2011 contre la vie chère, l'île connaît maintenant aussi de plus en plus de tensions socio‑économiques, notamment entre Mahorais et immigrés clandestins comoriens. De l'avis général, on assiste là aussi à une dégradation certaine en la matière dans l'île.En dehors de la chaleur contre laquelle il vaut mieux se protéger, il n'y a pas vraiment de contraintes climatiques. Même les cyclones qui parcourent l'Océan Indien lors de l'été austral ne frappent que très très rarement Mayotte.Pas vraiment de danger de faire de mauvaises rencontres. À la limite, les plongeurs devront juste faire attention aux coraux et à quelques poissons qui peuvent entraîner des coupures ou piqûres.

Il n'y a aucun consulat étranger à Mayotte, y compris des Comores qui ne reconnaissent toujours pas l'appartenance de Mayotte à la France.