Sans être indispensable à la découverte du pays, la location de véhicule est une option que choisissent certains lorsqu'ils voyagent à plusieurs ou désirent une liberté totale. On peut louer, dès lors qu'on a au moins 25 ans, aussi bien un véhicule avec que sans chauffeur. Comme il existe diverses sociétés internationales ou locales, il y a donc une certaine concurrence en matière de prix, même s'il faut surtout faire attention en plus aux assurances annexes, leurs garanties et franchises qui peuvent faire une sacrée différence en cas de problème. Bref, comptez dans les 40 US $/jour pour un premier prix et au moins le double pour un tout‑terrain qui sera avant tout utile si on compte sortir des sentiers battus.En matière de sécurité, il est plus que recommandé d'éviter de rouler de nuit et nécessaire d'utiliser les parkings gardés sans rien laisser à l'intérieur. Quant à traverser les frontières avec un véhicule de location, très très peu de loueurs l'autorisent et dans ce cas il est préférable alors de demander une confirmation écrite de l'agence le permettant. Dernière chose, les contrôles routiers sont assez nombreux et souvent sévères en Équateur.Reste qu'à la location classique d'un véhicule, il existe également la solution alternative d'affréter à la journée selon ses besoins un taxi ou tout autre véhicule avec chauffeur. Dans tous les cas, cela facilitera la vie par rapport à une location "traditionnelle" (conduite, caution, gestion des problèmes, etc) et au final ne coûtera pas excessivement cher. Ne serait‑ce que parce qu'on ne payera que pour les jours dont on a réellement besoin d'un véhicule.

Le bus demeure un excellent moyen de découvrir l'Équateur qui reste un petit pays à l'échelle sud‑américaine. Le réseau est très bien développé avec de nombreuses compagnies concurrentes et des lignes qui permettent d'aller partout ou presque. De plus, les fréquences sont nombreuses avec pour avantage que l'on a en général guère à attendre avant chaque départ. Hormis Quito qui en dispose de deux (Quitumbe au sud et Carcelen au nord), les villes n'ont qu'au mieux qu'une seule gare routière.En pratique, on trouvera au choix des bus/minibus "basiques" (les plus nombreux), un peu lents et bondés, et d'autres plus haut de gamme ("Ejecutivo") très bien pour les trajets de nuit ou les longs parcours. Dans tous les cas, les tarifs demeurent très abordables pour en gros 2 ou 3 US$ les 100 km au moins cher. En route, gardez un œil sur vos bagages et ne vous séparez pas de vos objets de valeur. Quant à "l'équipement" à prévoir, prenez toujours au moins une petite laine contre la clim si elle existe et surtout l'altitude, ainsi qu'un masque anti‑lumière et des boules Quiès pour les trajets nocturnes.À noter qu'au niveau des variantes en matière de véhicules, on trouve aussi, essentiellement en campagne, des camions ou pickups transformés en autobus (les rancheras), plus les fameux chiva qui sont des minibus typiques de la Colombie et de l'Équateur aux couleurs bariolées. Ces derniers ont cependant tendance à disparaître - ou servir de transport touristique - au profit de véhicules plus "classiques" et modernes.Comme dans d'autres pays andins, les camions peuvent servir parfois d'alternative aux bus. C'est plus ou moins payant (moins cher que le bus) et on voyage selon la place en cabine ou à l'arrière. Pour les touristes, c'est quand même plus une "expérience" ou une solution pour pallier un manque d'autres transports qu'un mode de locomotion à envisager pour circuler dans le pays.

Comme dans les autres pays andins de la région, on se doute que le vélo est loin d'être l'idéal pour voyager, entre dénivelés, altitude, climat, circulation et autres désagréments. C'est pour cela que ce moyen de locomotion s'adresse avant tout aux plus motivés ou alors très localement pour faire une balade.

C'est dans les zones peu ou mal desservies par les transports que le stop est pratiqué (parfois de façon payante) notamment auprès des camions. Donc, rien n'empêche d'essayer à l'occasion même si le prix plus que modique des transports n'oblige en rien de circuler dans le pays de la sorte.

Si à une époque on croyait encore un peu au train comme mode de transport dans le pays, désormais les choses ont changé. Avec la disparition de la compagnie nationale Ferrocarriles del Ecuador en 2020, tout le réseau public et les projets imaginés ont pris fin.Aujourd'hui seuls subsistent deux lignes touristiques avec le Tren Tayta Imbabura qui offre un court trajet touristique dans le nord (autour d'Ibarra) à la découverte du patrimoine local et surtout le célèbre Nariz del Diablo. Ce "Nez du Diable" qui est cette ligne mythique entre Alausi et Sibambe zigzaguant à travers la montagne, avec deux départs hébdomadaires, 2h30 à 3h00 de route et une trentaine de dollars en plein tarif. Bref, le train en Équateur, c'est uniquement pour le tourisme et en aucun cas pour se déplacer.

Comme dans tous les pays qui disposent d'un bout d'Amazonie, le bateau ou plus simplement la pirogue sont omniprésents dans cette partie du territoire équatorien où les routes sont rares. C'est même souvent d'ailleurs le seul moyen de déplacement possible entre les villages, hormis parfois les petits avions.En pratique, ces embarcations fonctionnent aussi bien sur le même principe que les bus avec (plus ou moins) des horaires et des dessertes définis, ou alors s'affrètent à la demande. Dans tous les cas, ou tout du moins pour les plus petits bateaux ou pirogues, prévoyez de quoi vous protéger du soleil et des moustiques de même que d'emballer vos affaires. À signaler qu'à partir de l'Equateur on peut rejoindre, via les différents rios, la région d'Iquitos au Pérou en 8 jours puis ensuite le fleuve Amazone jusqu'à son embouchure au Brésil.Sur le littoral Pacifique les possibilités de circuler le long des côtes ou sur les rivières sont également bien présentes. Là aussi la configuration des lieux fait que parfois il n'y a pas de routes ou que l'accès fluvial/maritime demeure le plus rapide.Si les Galapagos se découvrent sur l'eau, on y accède cependant uniquement par air pour ce qui est des transports publics. Il n'y a en effet aucun ferry entre l'archipel et le continent, et les cargos qui assurent régulièrement le ravitaillement ne sont pas autorisés à prendre des passagers.Par contre, les plaisanciers ont le droit de venir aux Galapagos avec leur voilier. Néanmoins il faut savoir que l'accès maritime et les déplacements à l'intérieur du parc marin sont très réglementés. Il est donc obligatoire de bien se renseigner avant, à commencer via le site officiel du Parc des Galapagos.Une fois sur place, les possibilités de transports sur l'eau pour tous ne manquent pas. Entre les îles habitées on trouvera ainsi des navettes publiques, et pour les autres les visites sont réglementées et impliquent de passer obligatoirement par des tours organisés en bateaux. Donc, le problème du transport lors de celles‑ci ne se pose pas.

En plus d'une multitude d'aérodromes locaux, l'Équateur possède une vingtaine d'aéroports disposant d'au moins une liaison régulière généralement vers Quito et/ou Guayaquil opérée par une compagnie locale. De fait, pour relier deux villes "secondaires", il y aura donc le plus souvent un changement à prévoir. Cela dit, hormis pour aller aux Galapagos ou faire Loja (au sud) - Quito, l'avion n'est pas forcément nécessaire vu les distances relativement faibles entre villes. À la limite, celui‑ci est plutôt d'abord un bon moyen de découvrir les magnifiques panoramas andins vus du ciel.Au niveau prix, les vols intérieurs ne sont pas onéreux. Le plus souvent un vol de la capitale vers n'importe quelle autre ville coûtera autour des 100 US$ le trajet. Seule exception - et de taille! - l'accès aux Galapagos qui, lui, au contraire revient cher aux visiteurs étrangers qui ont une majoration comparé aux nationaux. Sur cette ligne, comptez entre 250 et 500 US$ l'A/R, selon les époques, et n'hésitez pas à réserver tôt surtout qu'en plus les voyagistes locaux bloquent régulièrement des stocks de sièges pour leur clientèle, rendant ainsi difficile l'obtention de bons prix pour les voyageurs individuels.Ce sont les seules à proposer des vols domestiques.

•	Avianca Ecuador: c'est une filiale du colombien Avianca. Elle propose une dizaine de villes équatoriennes pour ses lignes intérieures.

•	Emetebe: cette toute petite compagnie n'assure que trois ou quatre dessertes internes aux Galapagos.

•	LATAM Ecuador: la filiale locale de LATAM limite ses dessertes internes à l'essentiel avec Quito, Guayaquil, Manta, Cuenca et les Galapagos.

Les taxis (jaunes) sont assez nombreux dans les villes et disposent généralement d'un compteur en état à Quito et Guayaquil; sinon il faut négocier sa course avant. De façon générale, les prix ne sont pas excessifs et on peut tabler pour un trajet urbain de jour entre 2 US$ (petite course) et 5 ou 6 US$ (longue course). Comme dans beaucoup de pays, les taxis peuvent également s'affréter par exemple à l'heure ou la journée pour les besoins d'une visite; au final cela coûte généralement moins cher qu'une location de voiture avec en prime les "soucis" en moins.

Même si le bus est le moyen de transport le plus pratique pour se déplacer, d'autres modes offrent également quelques intérêts, comme l'avion pour ces magnifiques panoramas sur les Andes (à prendre au moins une fois) et le bateau en région amazonienne où il n'y a d'ailleurs pas trop le choix.Bref, on pourra choisir de circuler essentiellement en bus tout en se faisant un petit plaisir en avion, voire à l'occasion en affrétant un véhicule pour les besoins d'une visite hors des sentiers battus. Mais, vu la taille réduite du pays, de toute façon les durées de transports entre les lieux ne seront jamais très importantes ni les tarifs trop onéreux.

Distances (km) entre les principales villes du pays: