Puerto Rico est depuis longtemps une escale "quasi incontournable" des paquebots. Le port de San Juan est d'ailleurs le terminal croisières le plus actif des Caraïbes et un des premiers au monde. Chaque année ce sont 1,4 million de passagers qui débarquent de près de 500 navires appartenant à 14 compagnies. En plus de San Juan, les ports de Ponce (au sud) et Mayagüez (à l'ouest) servent aussi dans une bien moindre mesure d'escales. Bref, aucun problème pour trouver une croisière incluant l'île à son programme.

Seules la République Dominicaine et les Îles Vierges américaines (St‑Thomas) ont droit à des liaisons régulières de/vers Puerto Rico.De/vers la République Dominicaine: il existe qu'une seule liaison ferries qui fait Santo Domingo - Mayaguez (ouest de Puerto Rico). Elle est opérée par America Cruise Ferries pour trois rotations hebdo, 12 heures de mer et dans les 100 US$ la traversée en premier prix.De/vers Saint‑Thomas: on trouve plus ou moins selon les époques une desserte ferry entre Fajardo (côte est) et St Thomas dans les Îles Vierges US. Un départ hebdo pour deux heures de mer et dans les 100 US$ l'A/R.