Salut,
je ne connais pas Miyako mais je suis allé à Ishigaki et j'ai visité plusieurs îles avoisinantes. Près d'Ishigaki se trouve l'île de Hateruma qui me semble être idéale pour le snorkeling. J'ai vraiment découvert là-bas donc je manque de points de comparaison mais j'ai trouvé ça magique.
D'autres îles comme kuroshima sont aussi très bien pour le snorkeling.
L'île d'Iriomote est effectivement très sauvage, on y trouve quelque chose comme 70% de la mangrove du
Japon. C'est un super endroit pour faire des randonnées, du kayak etc.
Sinon à Ishigaki même il y a un spot de plongée très réputé où l'on peut voir des raies manta.
Ce ballader entre Miyako et Ishigaki en 5 jours ça ne me paraît pas être une très bonne idée. Ca va te prendre du temps de faire le trajet, de t'installer à l'hôtel et de prendre tes repères sur les îles, hors 5 jours c'est déjà très court.