Oui, puisque l'idée pour toi est de découvrir
Tokyo, c'est une bonne idée de choisir deux quartiers différents. Je te suggère de retenir à tout prix Shibuya. Comme deuxième quartier, il y a bien sûr le choix... le plus judicieux étant d'être du coup un peu à l'opposé de Shibuya, donc pas forcément Shinjuku ou Roppongi. Asakusa au nord-est est bien sûr une bonne idée (préférable à Ueno à mon avis, sans en être très loin). Les quartiers de Jimbocho et Ochanomisu juste au nord du palais Impérial sont également sympas.
Évite Odaiba, inintéressant pour y séjourner, et Shinagawa, pas vraiment passionnant et un peu excentré au sud.